Taula de continguts
53 les relacions: Acoblament proteïna-proteïna, Alineament de seqüències, Alineament múltiple de seqüències, Aminoàcid, Angle díedre, Aplicació distribuïda, Aprenentatge automàtic, Àcid ribonucleic, Benchmark, Bioinformàtica estructural, Biologia computacional, Biotecnologia, Blue Gene, Cadena lateral, Complex proteic, Covariància, Cristal·lografia de raigs X, Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction, Dinàmica molecular, Disseny de proteïnes, Energia de Gibbs, Enllaç per pont d'hidrogen, Enzim, Estructura biomolecular, Estructura terciària de les proteïnes, Evolució, Folding@home, Foldit, Glicina, Hèlix alfa, Hidrofòbia, Homologia (biologia), Human Proteome Folding Project, Inferència bayesiana, Làmina beta, Màquina de vector de suport, Medicina, MicroARN, NP-complet, Nucleòtid, Paradoxa de Levinthal, Plegament proteic, Probabilitat condicionada, Procés estocàstic, Projecte Genoma Humà, Prolina, Proteïna, Proteïna globular, Química teòrica, Rosetta@home, ... Ampliar l'índex (3 més) »
Acoblament proteïna-proteïna
La predicció d'acoblament proteïna-proteïna, que en el context de la bioinformàtica sol denominar-se simplement com a acoblament proteïna-proteïna, és la determinació de l'estructura molecular de complexos formats per dues o més proteïnes sense mesurar-la experimentalment.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Acoblament proteïna-proteïna
Alineament de seqüències
Un alineament de seqüències en bioinformàtica és una forma de representar i comparar dues o més seqüències o cadenes d'ADN, ARN, o estructures primàries proteiques per ressaltar les seves zones de similitud, que podrien indicar relacions funcionals o evolutives entre els gens o proteïnes consultades.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Alineament de seqüències
Alineament múltiple de seqüències
ClustalX. Lalineament múltiple de seqüències (MSA, per les sigles en anglès) es refereix al procés o resultat d’un alineament de seqüències de tres o més seqüències biològiques, generalment proteïnes, ADN o ARN.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Alineament múltiple de seqüències
Aminoàcid
Els aminoàcids són compostos orgànics que contenen els grups funcionals amino (-NH₂) i carboxil (-COOH), així com una cadena lateral diferent en cada aminoàcid.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Aminoàcid
Angle díedre
Representació axonomètrica d'un angle diedre de 90°. Un angle díedre és cadascuna de les parts de l'espai delimitades per dos semiplans que parteixen d'una aresta comuna.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Angle díedre
Aplicació distribuïda
La computació distribuïda és un nou model informàtic que permet fer grans càlculs utilitzant milers d'ordinadors de voluntaris i així estalviant els costos d'un superordinador.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Aplicació distribuïda
Aprenentatge automàtic
Laprenentatge automàtic ("machine learning" en anglès) és un camp de la intel·ligència artificial que està dedicat al disseny, l'anàlisi i el desenvolupament d'algorismes i tècniques que permeten que les màquines evolucionin.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Aprenentatge automàtic
Àcid ribonucleic
Comparació de l'ARN amb l'ADN (en anglès) L'àcid ribonucleic (ARN, conegut igualment per la sigla anglesa RNA) és una molècula polimèrica que té un paper fonamental en la codificació, la descodificació, la regulació i l'empalmament dels gens.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Àcid ribonucleic
Benchmark
El benchmark és un índex de referència que serveix per mesurar el rendiment d'un sistema, una organització o component d'aquest, per comparar-lo amb altres sistemes o organitzacions que tenen el mateix objectiu.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Benchmark
Bioinformàtica estructural
La bioinformàtica estructural és la branca de bioinformàtica que està relacionada amb l'anàlisi i la predicció de l'estructura tridimensional de macromolècules biològiques com ara proteïnes, ARN, i ADN.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Bioinformàtica estructural
Biologia computacional
La biologia computacional és una disciplina que es basa en l'ús d'eines informàtiques aplicades al camp de la biologia.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Biologia computacional
Biotecnologia
Cristalls d'insulina. La biotecnologia és el conjunt de disciplines o ciències que té per objectiu l'estudi dels éssers vius o parts dels éssers vius per tal d'obtenir-ne béns i serveis.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Biotecnologia
Blue Gene
Màquina Blue Gene / P al Laboratori Nacional d'Argonne Blue Gene és un projecte de desenvolupament d'un súper ordinador originat per IBM el 1999, en col·laboració al Thomas J. Watson Research Center, el qual està format per una sèrie d'arquitectures d'alt rendiment (treballen amb FLops) que requereixen molt poca demanda d'energia.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Blue Gene
Cadena lateral
En química orgànica i en bioquímica, una cadena lateral és un grup químic unit a una estructura troncal.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Cadena lateral
Complex proteic
Proteïnes del ''Bacillus amyloliquefaciens'' formant un complex. Un complex proteic és un grup de dues o més proteïnes associades de forma molt estable formades per interaccions proteïna-proteïna.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Complex proteic
Covariància
Dins l'entorn de l'estadística la covariància és una mesura de dispersió conjunta de dues variables estadístiques.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Covariància
Cristal·lografia de raigs X
La cristal·lografia de raigs X pot localitzar cada àtom en una zeolita, la qual és un aluminosilicat amb moltes aplicacions importants com la purificació de l'aigua. La difracció o cristal·lografia de raigs X és una tècnica per a determinar la disposició dels àtoms dins un cristall, en aquest mètode un feix de raigs X colpeja el cristall i causa que el feix de llum s'estengui en moltes direccions específiques.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Cristal·lografia de raigs X
Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction
superposades (gris columnes C alfa) del CASP8 Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP) ("avaluació crítica de les tècniques per la predicció estructural proteica") és un experiment mundial comunitari per la predicció estructural proteica que es duu a terme cada dos dos anys des del 1994.
Dinàmica molecular
En la química, la dinàmica molecular (DM) és una tècnica de simulació en la qual es permet que àtoms i molècules interaccionin per un període.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Dinàmica molecular
Disseny de proteïnes
El disseny de proteïnes és el disseny de noves molècules proteiques des de zero o a partir d'una estructura coneguda.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Disseny de proteïnes
Energia de Gibbs
L'energia de Gibbs, també anomenada energia lliure de Gibbs i funció de Gibbs, és una funció d'estat, simbolitzada per G, que dona la condició d'equilibri i d'espontaneïtat per una reacció química i que està definida per la combinació de funcions d'estat: G \equiv U + P \cdot V - T \cdot S.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Energia de Gibbs
Enllaç per pont d'hidrogen
Enllaç per pont d'hidrogen entre molècules d'aigua simbolitzat amb línies discontínues Un enllaç per pont d'hidrogen és una forma d'associació entre un àtom electronegatiu i un àtom d'hidrogen enllaçat amb enllaç covalent a un segon àtom relativament electronegatiu.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Enllaç per pont d'hidrogen
Enzim
Diagrama de cintes de l'estructura terciària de la glioxalasa I humana. Els dos ions de zinc necessaris per catalitzar la reacció es mostren com a esferes lila i l'inhibidor enzimàtic S-hexilglutationa es mostra com a model de rebliment d'espai omplint les dues zones actives.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Enzim
Estructura biomolecular
Lestructura biomolecular és l'estructura de les biomolecules, principalment de les proteïnes i els àcids nucleics ADN i ARN.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Estructura biomolecular
Estructura terciària de les proteïnes
L'estructura terciària de les proteïnes, especialment de les que tenen un pes molecular elevat, està constituïda per diversos dominis o unitats compactes de 50 a 300 aminoàcids connectades a través de l'esquelet polipeptídic.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Estructura terciària de les proteïnes
Evolució
L'evolució és el procés segons el qual els caràcters hereditaris d'una població d'organismes canvien amb el pas de les generacions.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Evolució
Folding@home
El Folding@home (pronunciat "folding at home" en anglès) és un projecte de computació distribuïda dissenyat per realitzar simulacions per ordinador del plegament de proteïnes.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Folding@home
Foldit
Foldit és un videojoc de trencaclosques en línia centrat en el plegament de proteïnes.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Foldit
Glicina
La glicina (representat per les lletres Gly o G) és un dels aminoàcids transcripcionals que formen les proteïnes dels éssers vius.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Glicina
Hèlix alfa
Vista lateral a nivell atòmic de residus d'alanina d'una hèlix α En color fúcsia, estan ressaltats dos ponts d'hidrogen, que separen l'oxigen i l'hidrogen per 2 Å. La proteïna va cap amunt, és a dir, té l'extrem amino a dalt i l'extrem carboxílic a baix.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Hèlix alfa
Hidrofòbia
una gota de rosada en una cutícula (d'una planta) que resulta hidròfoba Una substància és hidròfoba (del grec υδρο, hydro.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Hidrofòbia
Homologia (biologia)
Carl Gegenbaur: Homologia entre membres anteriors (1870) En l'estudi comparatiu dels éssers vius, l'homologia és la relació que existeix entre dues parts orgàniques diferents quan els seus determinants genètics tenen el mateix origen evolutiu.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Homologia (biologia)
Human Proteome Folding Project
El Human Proteome Folding Project (HPF, «Projecte de Plegament del Proteoma Humà») és un projecte col·laboratiu de la Universitat de Nova York (Laboratori Bonneau), l'Institute for Systems Biology (ISB) i la Universitat de Washington (Laboratori Baker), que utilitza el programari Rosetta desenvolupat per Rosetta Commons.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Human Proteome Folding Project
Inferència bayesiana
La inferència bayesiana és una inferència estadística en la qual les proves o observacions es fan servir per actualitzar o novament per inferir la probabilitat que una hipòtesi pugui ser certa.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Inferència bayesiana
Làmina beta
La làmina β (o làmina β-plegada) és la segona forma d'estructura secundària de les proteïnes, només una mica menys comú que l'hèlix alfa.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Làmina beta
Màquina de vector de suport
Una màquina de vector de suport (SVM o support-vector machines en anglès) és un concepte al món estadístic i de les ciències de la computació sobre un conjunt d'algorismes que són capaços d'analitzar dades i reconèixer patrons mitjançant l'ús de mètodes d'aprenentatge supervisat.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Màquina de vector de suport
Medicina
Vara d'Esculapi, símbol de la medicina. La medicina és la branca de les ciències de la salut que s'ocupa de la prevenció, diagnòstic i tractament de les alteracions des del punt de vista de l'homeòstasi de les persones.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Medicina
MicroARN
En genètica, els microARNs (miARN) són molècules d'ARN unicatenari d'uns 21-23 nucleòtids de longitud mitjançant els quals es modula l'expressió d'altres gens.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і MicroARN
NP-complet
En complexitat computacional, el conjunt de problemes NP-complet, que son els problemes que pertanyen tant a NP com a NP-hard.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і NP-complet
Nucleòtid
Els nucleòtids són les unitats estructurals bàsiques dels àcids nucleics, és a dir que els àcids nucleics estan formats per l'encadenament de nucleòtids.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Nucleòtid
Paradoxa de Levinthal
La paradoxa de Levinthal és un experiment mental en la teoria del plegament de les proteïnes.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Paradoxa de Levinthal
Plegament proteic
Dibuix representant la configuració d'un polímer proteic (línia en la imatge esquerra) abans i després de replegar-se (dreta). Les cintes de la imatge plegada representen estructures organitzades com l'hèlix alfa o el full beta. El plegament proteic és el procés físic pel qual un polipèptid es replega en la seva estructura tridimensional característica i funcional.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Plegament proteic
Probabilitat condicionada
La probabilitat condicionada és la probabilitat que hi hagi un succés A, sabent que també succeeix un altre succés B. La probabilitat condicional s'escriu P(A|B), i es llegeix «la probabilitat de A donada B».
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Probabilitat condicionada
Procés estocàstic
L'índex borsari és un exemple de procés estocàstic de tipus no estacionari (per això no es pot predir) En teoria de probabilitat i generalment en el camp estadístic, un procés aleatori o procés estocàstic és un concepte matemàtic normalment definit com un conjunt de variables aleatòries.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Procés estocàstic
Projecte Genoma Humà
El Projecte Genoma Humà (PGH) (Human Genome Project -HGP- en anglès) fou un esforç internacional de recerca per determinar la seqüència del genoma humà i identificar-ne els gens que conté.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Projecte Genoma Humà
Prolina
La prolina (abreujada Pro o P) és un dels aminoàcids transcripcionals que formen les proteïnes dels éssers vius.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Prolina
Proteïna
Representació tridimensional de la mioglobina, que mostra acolorides les hèlix alfa. L'estructura d'aquesta proteïna va ser la primera que Max Perutz i Sir John Cowdery Kendrew van resoldre per cristal·lografia de raigs X l'any 1958, fet pel qual van rebre el Premi Nobel de Química de l'any 1962.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Proteïna
Proteïna globular
Estructura tridimensional de l'hemoglobina, una proteïna globular. Les proteïnes globulars, o esferoproteïnes són un dels tres tipus principals de la classificació de les ''proteïnes'' per la seva forma (globulars, fibroses i mixtes), i es diferencien fonamentalment de les fibroses per ser més o menys solubles en dissolucions aquoses (on formen suspensions ''col·loidals''), sent les fibroses pràcticament insolubles.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Proteïna globular
Química teòrica
La química teòrica és l'estudi de la química a través d'un raonament teòric fonamental, habitualment amb l'ajuda de les matemàtiques i de la física.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Química teòrica
Rosetta@home
Rosetta@home és un projecte de computació distribuïda per a la predicció de l'estructura de les proteïnes que utilitza la plataforma Berkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC).
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Rosetta@home
Seqüència motiu
Una seqüència motiu, en anglès: sequence motif, en genètica és un patró de seqüència de nucleòtids o aminoàcid que està molt estesa o que es conjectura que té significació biològica.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Seqüència motiu
Teoria de la informació
La teoria de la informació estudia la quantificació, l'emmagatzamatge i la comunicació de la informació.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Teoria de la informació
Xarxa neuronal artificial
Xarxa neuronal artificial perceptró simple amb 3 neurones d'entrada, 4 neurones en la seva capa oculta i una neurona de sortida. Una xarxa neuronal artificial (XNA), o senzillament xarxa neuronal (XN) és un paradigma d'aprenentatge i processament automàtic inspirat en la forma en què funciona el sistema nerviós dels animals.
Veure Predicció de l'estructura de les proteïnes і Xarxa neuronal artificial
També conegut com Predicció d'estructura de proteïnes.