Logo
Uniopèdia
Comunicació
Disponible a Google Play
Nou! Descarregar Uniopèdia al dispositiu Android™!
Descarregar
Accés més ràpid que el navegador!
 

Protein Data Bank

Índex Protein Data Bank

El Protein Data Bank (PDB) (Banc de dades de proteïnes), és un dipòsit d'estructures 3-D de proteïnes i àcids nucleics.

41 les relacions: Aconitasa, Actina, Alcohol deshidrogenasa, Amilasa, Àcid ceramidasa, Àcid retinoic, Àcid tetrahidrofòlic, Beta-lisina 5,6-aminomutasa, Bioinformàtica estructural, Biologia computacional, CLM, Coenzim Q: citocrom c – reductasa, Col·lagen, Complex del citocrom b6f, Criptocrom, Cristal·lografia de raigs X, Domini proteic, ERM, Glutatió peroxidasa, Hemeritrina, Hidrogenasa, Ió poliatòmic, Isopropil β-D-1-tiogalactopiranòsid, Lamina A/C, Llista de sigles de tres lletres, Louise Johnson, MreB, Olga Kennard, ORP1L, P38 MAPK, PDBsum, Profilina, Proteïna, Proteïna d'unió a C4b, RasMol, Rosetta@home, T-Coffee, TLR1, Tobramicina, Transcriptasa inversa, UniProt.

Aconitasa

L'aconitasa o aconitat hidratasa és un enzim que catalitza la isomerització estereoespecífica de citrat a isocitrat a través de cis-aconitat en el cicle de Krebs.

Nou!!: Protein Data Bank і Aconitasa · Veure més »

Actina

format.

Nou!!: Protein Data Bank і Actina · Veure més »

Alcohol deshidrogenasa

doi.

Nou!!: Protein Data Bank і Alcohol deshidrogenasa · Veure més »

Amilasa

L'amilasa, anomenada també ptialina és un enzim hidrolasa que té la funció de trencar el glucogen i el midó en sucres simples.

Nou!!: Protein Data Bank і Amilasa · Veure més »

Àcid ceramidasa

Representació 3D de la ceramidasa àcidaInfotaula enzim La ceramidasa àcida o enzim àcid ceramidasa (AC o aCDase), codificat pel gen ASAH1, és un enzim que hidrolitza la ceramida de la membrana lisosomal en un àcid gras i en esfingosina, part fonamental de tots els esfingolípids, per regular molts processos cel·lulars.

Nou!!: Protein Data Bank і Àcid ceramidasa · Veure més »

Àcid retinoic

Àcid retinoic és un metabòlit de la vitamina A (retinol) que intervé en les funcions de la vitamina A requerida per al creixement i el desenvolupament dels animals cordats (inclou des dels peixos als humans).

Nou!!: Protein Data Bank і Àcid retinoic · Veure més »

Àcid tetrahidrofòlic

L'àcid tetrahidrofòlic, o tetrahidrofolat, és un derivat de l'àcid fòlic.

Nou!!: Protein Data Bank і Àcid tetrahidrofòlic · Veure més »

Beta-lisina 5,6-aminomutasa

En enzimologia una beta-lisina 5,6-aminomutasa (EC 5.4.3.3) és un enzim que catalitza la reacció química: (3S)-3,6-diaminohexanoat (3S,5S)\rightleftharpoons3,5-diaminohexanoat D'aquí, aquest enzim té un substrat (3S)-3,6-diaminohexanoat, i un producte, (3S,5S)-3,5-diaminohexanoat.

Nou!!: Protein Data Bank і Beta-lisina 5,6-aminomutasa · Veure més »

Bioinformàtica estructural

La bioinformàtica estructural és la branca de bioinformàtica que està relacionada amb l'anàlisi i la predicció de l'estructura tridimensional de macromolècules biològiques com ara proteïnes, ARN, i ADN.

Nou!!: Protein Data Bank і Bioinformàtica estructural · Veure més »

Biologia computacional

La biologia computacional és una disciplina que es basa en l'ús d'eines informàtiques aplicades al camp de la biologia.

Nou!!: Protein Data Bank і Biologia computacional · Veure més »

CLM

* Castella - la Manxa, comunitat autònoma d'Espanya.

Nou!!: Protein Data Bank і CLM · Veure més »

Coenzim Q: citocrom c – reductasa

Coenzim Q: citocrom c – reductasa heterononamer, Gallus gallus. Il·lustració esquemàtica del Complex III El coenzim Q: citocrom c – oxidoreductasa, a vegades anomenat el complex citocrom bc1, i en altres ocasions complex III, és el tercer complex a la cadena respiratòria, jugant un paper clau en la generació bioquímica de l'ATP per fosforilació oxidativa durant la respiració cel·lular.

Nou!!: Protein Data Bank і Coenzim Q: citocrom c – reductasa · Veure més »

Col·lagen

Representació de la triple hèlix del tropocol·làgen. El col·lagen és una molècula proteica que forma fibres, les fibres col·làgenes, que estan presents en quantitat variable en quasi tots els tipus de teixit conjuntiu.

Nou!!: Protein Data Bank і Col·lagen · Veure més »

Complex del citocrom b6f

Complex del citocrom b6f. Els límits de la bicapa lipídica es mostren com la línia vermella i blava Complex del citocrom b₆f o plastoquinol—plastocianina reductasa és un complex enzimàtic propi dels cloroplasts i dels cianobacteris.

Nou!!: Protein Data Bank і Complex del citocrom b6f · Veure més »

Criptocrom

Els criptocroms (del grec κρυπτό χρώμα, color ocult) són una classe de flavoproteïnes sensibles a la regió del balu que es troben en animals i plantes.

Nou!!: Protein Data Bank і Criptocrom · Veure més »

Cristal·lografia de raigs X

La cristal·lografia de raigs X pot localitzar cada àtom en una zeolita, la qual és un aluminosilicat amb moltes aplicacions importants com la purificació de l'aigua. La difracció o cristal·lografia de raigs X és una tècnica per a determinar la disposició dels àtoms dins un cristall, en aquest mètode un feix de raigs X colpeja el cristall i causa que el feix de llum s'estengui en moltes direccions específiques.

Nou!!: Protein Data Bank і Cristal·lografia de raigs X · Veure més »

Domini proteic

Proteïna amb set dominis diferents. Cada color correspon a un domini diferent. Un domini proteic és una agrupació globular de cadenes polipeptídiques que forma una regió molt conservada d'una proteïna, i que té una estructura terciària que pot existir, funcionar i evolucionar independentment de la resta de la cadena peptídica.

Nou!!: Protein Data Bank і Domini proteic · Veure més »

ERM

Les proteïnes ERM inclou a les tres proteïnes Ezrin (82KDa), Radixin (80KDa) i Moesin (75KDa) que actuen d'unió entre la membrana plasmàtica i el citoesquelet regulant l'estructura i la funció de dominis específics de la membrana plasmàtica.

Nou!!: Protein Data Bank і ERM · Veure més »

Glutatió peroxidasa

La glutatió peroxidasa (PDB 1GP1) és el nom genèric d'una família d'enzims amb activitat peroxidasa que, com a principal rol biològic, tenen la funció de protegir els organismes del dany oxidatiu.

Nou!!: Protein Data Bank і Glutatió peroxidasa · Veure més »

Hemeritrina

Hemeritrina oxigenada Complex trimèric d'hemeritrina Hemeritrina, (en anglès:Hemerythrin o haemerythrin); del grec αίμα.

Nou!!: Protein Data Bank і Hemeritrina · Veure més »

Hidrogenasa

Estructura del lloc actiu de les hidrogenases NiFe La hidrogenasa és una proteïna que pertany al grup dels enzims que catalitzen reaccions en els sistemes biológics.

Nou!!: Protein Data Bank і Hidrogenasa · Veure més »

Ió poliatòmic

O₃−). Les zones de color vermell són d'energia més baixa que les de color groc Un ió poliatòmic, també conegut com a ió molecular, és una espècie química (ió) carregada composta de dos o més àtoms enllaçats amb un enllaç covalent o un complex químic metàl·lic que es pot considerar com que actua com una única unitat en el context de la química d'àcid base en la formació de sals.

Nou!!: Protein Data Bank і Ió poliatòmic · Veure més »

Isopropil β-D-1-tiogalactopiranòsid

L'isopropil β-D-1-tiogalactopiranòsid (IPTG) és un reactiu usat en biologia molecular.

Nou!!: Protein Data Bank і Isopropil β-D-1-tiogalactopiranòsid · Veure més »

Lamina A/C

La lamina A/C és un dels principals components de la làmina nuclear, tot i que també es troba distribuïda pel nucleoplasma en menor concentració.

Nou!!: Protein Data Bank і Lamina A/C · Veure més »

Llista de sigles de tres lletres

A continuació es mostra una taula amb la llista de sigles de tres lletres de la A a la Z (només majúscules).

Nou!!: Protein Data Bank і Llista de sigles de tres lletres · Veure més »

Louise Johnson

Louise Napier Johnson, DBE, FRS (Worcester, 26 de setembre de 1940 – 25 de setembre de 2012) va ser una bioquímica i cristalógrafa britànica, professora de la Càtedra "David Phillips" de Biofísica Molecular a la Universitat d'Oxford de 1990 a 2007, i posteriorment professora emèrita.

Nou!!: Protein Data Bank і Louise Johnson · Veure més »

MreB

doi.

Nou!!: Protein Data Bank і MreB · Veure més »

Olga Kennard

Olga Weisz, coneguda pel seu nom de casada Olga Kennard, OBE, FRS (Budapest, 23 de març de 1924 - 2 de març de 2023) va ser una científica britànica especialitzada en cristal·lografia i fundadora del Cambridge Crystallographic Data Centre.

Nou!!: Protein Data Bank і Olga Kennard · Veure més »

ORP1L

La proteïna ORP1L (nom complet: oxysterol-binding protein-related protein 1L, també anomenada OSBPL1A, OPR-1 o OSBPL1B), és una proteïna d'unió a Oxisterol, pertanyent per tant a la família proteïca descoberta en els anys 80 de les Oxysterol-binding proteins.

Nou!!: Protein Data Bank і ORP1L · Veure més »

P38 MAPK

p38 MAPK conformen una família de proteïnes cinases activades per mitogens, sensibles a estímuls d'estrès i tensions ambientals com ara les citocines, la radiació ultraviolada, el xoc tèrmic i el xoc osmòtic.

Nou!!: Protein Data Bank і P38 MAPK · Veure més »

PDBsum

PDBSum és una base de dades que proporciona una visió general en tres dimensions del contingut de cada estructura macromolecular dipositada a la Protein Data Bank.

Nou!!: Protein Data Bank і PDBsum · Veure més »

Profilina

PDB, codi: 1BTF). La profilina és una proteïna d'unió a actina involucrada en l'equilibri dinàmic d'acoblament del citoesquelet d'actina.

Nou!!: Protein Data Bank і Profilina · Veure més »

Proteïna

Representació tridimensional de la mioglobina, que mostra acolorides les hèlix alfa. L'estructura d'aquesta proteïna va ser la primera que Max Perutz i Sir John Cowdery Kendrew van resoldre per cristal·lografia de raigs X l'any 1958, fet pel qual van rebre el Premi Nobel de Química de l'any 1962. Les proteïnes, també denominades polipèptids, són compostos orgànics fets d'aminoàcids arranjats en una cadena lineal i units per enllaços peptídics entre els grups carboxil i amino de residus adjacents.

Nou!!: Protein Data Bank і Proteïna · Veure més »

Proteïna d'unió a C4b

La proteïna d'unió a C4b (en anglès C4b-binding protein o complement C4b-binding protein) és una llarga glicoproteïna plasmàtica reguladora de la via clàssica del sistema del complement humà, en la qual intervé fonamentalment com a cofactor amb funcions inhibidores.

Nou!!: Protein Data Bank і Proteïna d'unió a C4b · Veure més »

RasMol

RasMol és un programa de visualització molecular per a la representació i exploració de les estructures de les macromolècules biològiques, com ara les que es troben al Protein Data Bank.

Nou!!: Protein Data Bank і RasMol · Veure més »

Rosetta@home

Rosetta@home és un projecte de computació distribuïda per a la predicció de l'estructura de les proteïnes que utilitza la plataforma Berkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC).

Nou!!: Protein Data Bank і Rosetta@home · Veure més »

T-Coffee

T-Coffee (Tree-based Consistency Objective Function For alignment Evaluation) és una aplicació bioinformàtica utilitzada per a l'alineament múltiple de seqüències que utilitza un algorisme progressiu avaluat mitjançant la consistència emprant una llibreria d'alineaments.

Nou!!: Protein Data Bank і T-Coffee · Veure més »

TLR1

Estructura receptor tipus Toll 1 (Wikipedia commons) El receptor de tipus Toll 1 (TLR1 o també anomenat CD281, toll-like receptor en anglès) és una proteïna que, com el seu nom indica, pertany a la família dels receptors tipus Toll (TLR).

Nou!!: Protein Data Bank і TLR1 · Veure més »

Tobramicina

La tobramicina (en anglès:Tobramycin) és un antibiòtic aminoglicòsid que deriva de Streptomyces tenebrarius i es fa servir contra diversos tipus d'infeccions per bacteris particularment els gram negatius.

Nou!!: Protein Data Bank і Tobramicina · Veure més »

Transcriptasa inversa

La transcriptasa inversa o retrotranscriptasa (RT en anglès) és el nom que es dona a un conjunt d'enzims de tipus ADN-polimerasa, que tenen com a funció sintetitzar ADN de doble cadena utilitzant com a motlle ARN monocatenari, és a dir, catalitzar la retrotranscripció o transcripció inversa.

Nou!!: Protein Data Bank і Transcriptasa inversa · Veure més »

UniProt

UniProt (Universal Protein Resource) és una base de dades de seqüències de proteïnes i la seva corresponent informació funcional.

Nou!!: Protein Data Bank і UniProt · Veure més »

Redirigeix aquí:

PDB.

SortintEntrant
Hey! Estem a Facebook ara! »