Logo
Uniopèdia
Comunicació
Disponible a Google Play
Nou! Descarregar Uniopèdia al dispositiu Android™!
Gratis
Accés més ràpid que el navegador!
 

Predicció de gens

Índex Predicció de gens

ADN. En general, la predicció de gens tracta de localitzar en les llargues seqüències d'ADN, i de forma automatitzada, les subsecuencias de nucleòtids que conformen els diferents gens. Els mecanismes o processos de predicció de gens (general Prediction en anglès, o també general finding, literalment descobriment de gens) són aquells que, dins l'àrea de la biologia computacional, s'utilitzen per a la identificació algorísmica de trossos de seqüència, usualment ADN genòmic, i que són biològicament funcionals.

37 les relacions: Alineament de seqüències, Aprenentatge automàtic, ARN missatger, Àcid desoxiribonucleic, Biologia computacional, BLAST, Codi genètic, Cromosoma, Empalmament, Ensembl, Estructura biomolecular, Eucariotes, Factor de transcripció, Gen, Genòmica, Homologia (biologia), In vivo, Lligament genètic, Marc obert de lectura, Màquina de vector de suport, Model estadístic, Model ocult de Màrkov, Nucleòtid, Parell de bases, Procariotes, Projecte Genoma Humà, Promotor, Proteïna, RefSeq, Selecció natural, Seqüència reguladora, Seqüenciació, Seqüenciació d'ADN, Silenciament gènic, Transcripció genètica, Transformada de Fourier, Triplet (biologia).

Alineament de seqüències

Un alineament de seqüències en bioinformàtica és una forma de representar i comparar dues o més seqüències o cadenes d'ADN, ARN, o estructures primàries proteiques per ressaltar les seves zones de similitud, que podrien indicar relacions funcionals o evolutives entre els gens o proteïnes consultades.

Nou!!: Predicció de gens і Alineament de seqüències · Veure més »

Aprenentatge automàtic

Laprenentatge automàtic ("machine learning" en anglès) és un camp de la intel·ligència artificial que està dedicat al disseny, l'anàlisi i el desenvolupament d'algorismes i tècniques que permeten que les màquines evolucionin.

Nou!!: Predicció de gens і Aprenentatge automàtic · Veure més »

ARN missatger

traduït una o més vegades i, finalment, és degradat. L'àcid ribonucleic missatger (ARNm o mRNA) és una molècula d'ARN que serveix de model químic per a crear un producte proteic.

Nou!!: Predicció de gens і ARN missatger · Veure més »

Àcid desoxiribonucleic

Làcid desoxiribonucleic (ADN, conegut igualment per la sigla anglesa DNA) és una molècula composta de dues cadenes de polinucleòtids enrotllades al llarg d'un eix comú que formen una doble hèlix amb les instruccions genètiques per al desenvolupament, el funcionament, el creixement i la reproducció de tots els organismes coneguts i molts virus.

Nou!!: Predicció de gens і Àcid desoxiribonucleic · Veure més »

Biologia computacional

La biologia computacional és una disciplina que es basa en l'ús d'eines informàtiques aplicades al camp de la biologia.

Nou!!: Predicció de gens і Biologia computacional · Veure més »

BLAST

El BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) és un programa informàtic d'alineament de seqüències de tipus local ja sigui d'ADN o de proteïnes.

Nou!!: Predicció de gens і BLAST · Veure més »

Codi genètic

Els cromosomes, formats per una doble hèlix d'ADN, contenen la informació genètica d'un individu, és a dir, les "instruccions" per fabricar les proteïnes (bàsicament enzims) que controlaran les reaccions químiques de la cèl·lula, el seu funcionament. El codi genètic NO és la informació continguda en els cromosomes, sinó el codi que la cèl·lula utilitza per desxifrar el missatge contingut en els cromosomes. En altres paraules: el codi genètic és la correspondència entre dos "llenguatges": el llenguatge de nucleòtids que utilitza l'ADN i el llenguatge d'aminoàcids en què es basen les proteïnes. Podríem dir que el codi genètic és el diccionari bilingüe "nucleòtids-aminoàcids" En genètica, el codi genètic és un conjunt de normes que permeten la conversió de seqüències d'àcids nucleics (ADN o ARN) en proteïnes dins les cèl·lules dels éssers vius, en el procés de síntesi de proteïnes.

Nou!!: Predicció de gens і Codi genètic · Veure més »

Cromosoma

En biologia, un cromosoma (del grec χρώμα khroma, 'color', i σώμα soma, 'cos') és cadascun dels petits cossos amb forma de bastonets que s'organitzen a la cromatina del nucli cel·lular durant les divisions cel·lulars (mitosi i meiosi) dels organismes eucariotes.

Nou!!: Predicció de gens і Cromosoma · Veure més »

Empalmament

introns (en blau) abans de ser processada i a sota després del procés d'empalmament. Diagrama il·lustratiu de la bioquímica en dos passos de l'empalmament L'empalmament (sovint anomenat erròniament amb l'anglicisme splicing) és el procés postranscripcional (i pretraduccional) mitjançant el qual les seqüències intròniques són eliminades del pre-ARNm i els exons que els separaven són units entre ells per formar l'ARNm madur que serà traduït a proteïna.

Nou!!: Predicció de gens і Empalmament · Veure més »

Ensembl

Ensembl és un projecte científic conjunt entre l'Institut Bioinformàtic Europeu i el Wellcome Trust Sanger Institute (ambdós amb seu a Cambridge, Regne Unit), el qual va ser fundat el 1999 com a resposta a la finalització imminent del Projecte del Genoma Humà. Després de 10 anys d'existència, l'objectiu d'Ensembl segueixent sent proporcionar un recurs centralitzat per genetistes, biòlegs moleculars i altres investigadors que estudien els genomes de l'espècie humana i d'altres vertebrats i organismes model.

Nou!!: Predicció de gens і Ensembl · Veure més »

Estructura biomolecular

Lestructura biomolecular és l'estructura de les biomolecules, principalment de les proteïnes i els àcids nucleics ADN i ARN.

Nou!!: Predicció de gens і Estructura biomolecular · Veure més »

Eucariotes

Arbre filogenètic. Els eucariotes apareixen en marró, a la dreta. Els noms científics en llatí apareixen en cursiva. Els eucariotes (de noms científics Eucaryotae, Eukaryotae, Eukarya o Eucarya) són, en taxonomia i histologia, el domini d'organismes cel·lulars amb nucli diferenciat, i altres orgànuls tancats dins de les membranes biològiques, contraposats així als procariotes.

Nou!!: Predicció de gens і Eucariotes · Veure més »

Factor de transcripció

En el camp de la biologia molecular, un factor de transcripció és una proteïna que s'uneix a seqüències d'ADN específiques i controla la transferència (o transcripció) de la informació genètica de l'ADN a l'ARNm.

Nou!!: Predicció de gens і Factor de transcripció · Veure més »

Gen

Un gen és una seqüència lineal de nucleòtids d'ADN o ARN que és essencial per a una funció específica, ja sigui en el desenvolupament de l'ésser o en el manteniment d'una funció fisiològica normal.

Nou!!: Predicció de gens і Gen · Veure més »

Genòmica

La genòmica és l'estudi del genoma d'un organisme i de la seva funció.

Nou!!: Predicció de gens і Genòmica · Veure més »

Homologia (biologia)

Carl Gegenbaur: Homologia entre membres anteriors (1870) En l'estudi comparatiu dels éssers vius, l'homologia és la relació que existeix entre dues parts orgàniques diferents quan els seus determinants genètics tenen el mateix origen evolutiu.

Nou!!: Predicció de gens і Homologia (biologia) · Veure més »

In vivo

In vivo és una expressió llatina que s'utilitza per descriure experiments químics, físics o farmacològics que tenen lloc dins d'un organisme viu, per oposició als que es duen a terme en un ambient artificial (in vitro).

Nou!!: Predicció de gens і In vivo · Veure més »

Lligament genètic

En genètica es denomina lligament l'associació física entre dos loci (això és, la seva proximitat en una mateixa cadena d'ADN, cosa que repercuteix en una baixa freqüència de recombinació entre ells durant la meiosi, i, per tant, a una major probabilitat d'herència conjunta. Això és degut al fet que els quiasmes, estructures d'entrecreuament generades durant la recombinació, es produeixen a l'atzar al llarg d'un cromosoma; d'aquesta manera, a menor distància entre dos loci, menor probabilitat que es doni un quiasma i, per tant, es generin variants recombinants. La disposició de dos loci amb màxima freqüència de recombinació (això és, de 0,5 o, cosa que és el mateix, del 50%) és sobre cromosomes separats, car, així, si només es transmet les cèl·lules germinals una còpia del genoma i existeixen dos cromosomes homòlegs (el patern i el matern) a la cèl·lula diploide de la línia germinal, la seva segregació a l'atzar donarà lloc a la transmissió d'un dels dos, i 1/2 correspon a la mencionada freqüència de recombinació de 0,5. Quan els dos locus es troben en cromosomes diferents es diu que no estan lligats: és una situació de no lligament.

Nou!!: Predicció de gens і Lligament genètic · Veure més »

Marc obert de lectura

Una pauta oberta o marc obert de lectura, també coneguda per l'acrònim ORF (de l'expressió anglesa open reading frame), és una seqüència de nucleòtids que potencialment pot codificar una proteïna, ja que està compresa entre una seqüència d'inici (codó d'inici) i una seqüència de terminació (codó d'aturada o codó de stop).

Nou!!: Predicció de gens і Marc obert de lectura · Veure més »

Màquina de vector de suport

Una màquina de vector de suport (SVM o support-vector machines en anglès) és un concepte al món estadístic i de les ciències de la computació sobre un conjunt d'algorismes que són capaços d'analitzar dades i reconèixer patrons mitjançant l'ús de mètodes d'aprenentatge supervisat.

Nou!!: Predicció de gens і Màquina de vector de suport · Veure més »

Model estadístic

Un model estadístic és una expressió simbòlica en forma d'igualtat o equació que es fa servir en tots els dissenys experimentals i en la regressió per indicar els diferents factors que modifiquen la variable de resposta.

Nou!!: Predicció de gens і Model estadístic · Veure més »

Model ocult de Màrkov

Exemple de transició d'estats en un model ocult de Màrkov ''x'' — estats ocults ''y'' — eixides observables ''a'' — probabilitats de transició ''b'' — probabilitats d'eixida Un model ocult de Màrkov o HMM (per les seves sigles de l'anglès, Hidden Markov Model) és un model estadístic en el qual s'entén que el sistema a modelar és un procés de Màrkov de paràmetres desconeguts.

Nou!!: Predicció de gens і Model ocult de Màrkov · Veure més »

Nucleòtid

Els nucleòtids són les unitats estructurals bàsiques dels àcids nucleics, és a dir que els àcids nucleics estan formats per l'encadenament de nucleòtids.

Nou!!: Predicció de gens і Nucleòtid · Veure més »

Parell de bases

En biologia molecular el terme parell de bases (bp, de l'anglès base pair) s'empra com a mesura de longitud d'àcids nucleics de cadena doble (ADN generalment).

Nou!!: Predicció de gens і Parell de bases · Veure més »

Procariotes

Arbre filogenètic. Els procariotes són els dos arbres de l'esquerra. Els noms científics en llatí apareixen en cursiva. Els procariotes (del grec pros.

Nou!!: Predicció de gens і Procariotes · Veure més »

Projecte Genoma Humà

El Projecte Genoma Humà (PGH) (Human Genome Project -HGP- en anglès) fou un esforç internacional de recerca per determinar la seqüència del genoma humà i identificar-ne els gens que conté.

Nou!!: Predicció de gens і Projecte Genoma Humà · Veure més »

Promotor

En el camp de la biologia molecular, els promotors són seqüències de DNA que dirigeixen la transcripció d'un gen adjacent a aquest.

Nou!!: Predicció de gens і Promotor · Veure més »

Proteïna

Representació tridimensional de la mioglobina, que mostra acolorides les hèlix alfa. L'estructura d'aquesta proteïna va ser la primera que Max Perutz i Sir John Cowdery Kendrew van resoldre per cristal·lografia de raigs X l'any 1958, fet pel qual van rebre el Premi Nobel de Química de l'any 1962. Les proteïnes, també denominades polipèptids, són compostos orgànics fets d'aminoàcids arranjats en una cadena lineal i units per enllaços peptídics entre els grups carboxil i amino de residus adjacents.

Nou!!: Predicció de gens і Proteïna · Veure més »

RefSeq

La RefSeq —en anglès Reference Sequence, seqüència de referència— és una base de dadesPruitt KD, Tatusova T, Maglott DR (2005) d'accés obert, anotada i curada manualment, que conté seqüències nucleotídiques (ADN, ARN) i els seus productes proteics.

Nou!!: Predicció de gens і RefSeq · Veure més »

Selecció natural

Forma «típica» i forma «carbonària», d'una arna que està sobre el mateix arbre. La forma típica és més difícil de veure en un arbre dins una zona sense contaminació i es camufla millor dels seus depredadors. La selecció natural és el procés gradual no aleatori pel qual els patrons biològics esdevenen més o menys comuns dins d'una població com a funció de la reproducció diferencial dels seus progenitors.

Nou!!: Predicció de gens і Selecció natural · Veure més »

Seqüència reguladora

Una seqüència reguladora (també anomenada regió reguladora o element regulador) és un segment d'ADN on les proteïnes d'unió a l'ADN, com ara els factors de transcripció, es lliguen de manera preferent.

Nou!!: Predicció de gens і Seqüència reguladora · Veure més »

Seqüenciació

La seqüenciació en bioquímica, consisteix a determinar l'ordre linear dels components d'una macromolècula (els aminoàcids d'una proteïna, els nucleòtids d'un àcid nucleic com l'ADN, els monosacàrids d'un polisacàrid, etc.). En genètica, la seqüenciació concerneix la determinació de la seqüència dels gens fins i tot dels cromosomes, i del genoma complet.

Nou!!: Predicció de gens і Seqüenciació · Veure més »

Seqüenciació d'ADN

La seqüenciació d'ADN és cadascun dels mètodes de laboratori que tenen per objectiu determinar l'ordre dels nucleòtids adenina, guanina, citosina, i timina en un fragment d'ADN.

Nou!!: Predicció de gens і Seqüenciació d'ADN · Veure més »

Silenciament gènic

El silenciament gènic és un procés que es duu a terme en els organismes eucariotes, amb diferents objectius, entre els quals destaquen la regulació de l'expressió i l'eliminació i el control de material genètic aliè o extern (virus i transposons) que podria causar un mal a la cèl·lula.

Nou!!: Predicció de gens і Silenciament gènic · Veure més »

Transcripció genètica

Transcripció de l'ADN a ARNLa transcripció de l'ADN és el primer procés de l'expressió genètica.

Nou!!: Predicció de gens і Transcripció genètica · Veure més »

Transformada de Fourier

La transformada de Fourier descompon una funció temporal (un senyal) en les freqüències que la constitueixen.

Nou!!: Predicció de gens і Transformada de Fourier · Veure més »

Triplet (biologia)

Un triplet és la seqüència de tres nucleòtids en un àcid nucleic, i en particular en un ARN missatger.

Nou!!: Predicció de gens і Triplet (biologia) · Veure més »

SortintEntrant
Hey! Estem a Facebook ara! »