Logo
Uniopèdia
Comunicació
Disponible a Google Play
Nou! Descarregar Uniopèdia al dispositiu Android™!
Gratis
Accés més ràpid que el navegador!
 

Alineament de seqüències

Índex Alineament de seqüències

Un alineament de seqüències en bioinformàtica és una forma de representar i comparar dues o més seqüències o cadenes d'ADN, ARN, o estructures primàries proteiques per ressaltar les seves zones de similitud, que podrien indicar relacions funcionals o evolutives entre els gens o proteïnes consultades.

31 les relacions: Algorisme de Needleman-Wunsch, Algorisme de Smith-Waterman, Alineament múltiple de seqüències, Assemblatge de seqüències, Àcid desoxiribonucleic, Biologia computacional, BLAST, BLOSUM, Cèl·lula, CDD, Clustal, Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction, Distància de Levenshtein, Earth BioGenome Project, EMBOSS, Ensembl, Exploració de patrons seqüencials, FASTA, Filoviridae, Gap penalty, GenBank, HMMER, K-mer, Matriu de punts, Matriu de substitució, Peak calling, Predicció de gens, Predicció de l'estructura de les proteïnes, Seqüència conservada, T-Coffee, UniProt.

Algorisme de Needleman-Wunsch

L'algorisme de Needleman–Wunsch és un algorisme àmpliament utilitzat en bioinformàtica per a l'alineament global de seqüències proteiques o nucleotídiques.

Nou!!: Alineament de seqüències і Algorisme de Needleman-Wunsch · Veure més »

Algorisme de Smith-Waterman

L'algorisme de Smith-Waterman és un dels algorismes més emprats per a l'alineament local de seqüències proteiques o nucleotídiques, i en permet determinar les regions de major similitud.

Nou!!: Alineament de seqüències і Algorisme de Smith-Waterman · Veure més »

Alineament múltiple de seqüències

ClustalX. Lalineament múltiple de seqüències (MSA, per les sigles en anglès) es refereix al procés o resultat d’un alineament de seqüències de tres o més seqüències biològiques, generalment proteïnes, ADN o ARN.

Nou!!: Alineament de seqüències і Alineament múltiple de seqüències · Veure més »

Assemblatge de seqüències

En bioinformàtica, l'assemblatge de seqüències es refereix a alinear i fusionar fragments curts d'una seqüència d'ADN per tal de reconstruir la seqüència original més llarga.

Nou!!: Alineament de seqüències і Assemblatge de seqüències · Veure més »

Àcid desoxiribonucleic

Làcid desoxiribonucleic (ADN, conegut igualment per la sigla anglesa DNA) és una molècula composta de dues cadenes de polinucleòtids enrotllades al llarg d'un eix comú que formen una doble hèlix amb les instruccions genètiques per al desenvolupament, el funcionament, el creixement i la reproducció de tots els organismes coneguts i molts virus.

Nou!!: Alineament de seqüències і Àcid desoxiribonucleic · Veure més »

Biologia computacional

La biologia computacional és una disciplina que es basa en l'ús d'eines informàtiques aplicades al camp de la biologia.

Nou!!: Alineament de seqüències і Biologia computacional · Veure més »

BLAST

El BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) és un programa informàtic d'alineament de seqüències de tipus local ja sigui d'ADN o de proteïnes.

Nou!!: Alineament de seqüències і BLAST · Veure més »

BLOSUM

BLOSUM 62 A la bioinformàtica, la matriu BLOSUM (Matriu de SUbstitució de BLOcs) és una matriu de substitució utilitzada per tal de puntuar '''alineaments''' '''de seqüències''' de proteïnes divergents evolutivament..

Nou!!: Alineament de seqüències і BLOSUM · Veure més »

Cèl·lula

Una cèl·lula (del llatí cellula, diminutiu de cella, 'cel·la') és la unitat bàsica estructural i funcional de tot ésser viu i, de fet, l'element més petit que es pot considerar viu.

Nou!!: Alineament de seqüències і Cèl·lula · Veure més »

CDD

* Classificació Decimal de Dewey, sistema de classificació de documents desenvolupat per Melvil Dewey.

Nou!!: Alineament de seqüències і CDD · Veure més »

Clustal

Clustal és un programa d'ordinador àmpliament utilitzat per a l'alineament múltiple de seqüències.

Nou!!: Alineament de seqüències і Clustal · Veure més »

Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction

superposades (gris columnes C alfa) del CASP8 Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP) ("avaluació crítica de les tècniques per la predicció estructural proteica") és un experiment mundial comunitari per la predicció estructural proteica que es duu a terme cada dos dos anys des del 1994.

Nou!!: Alineament de seqüències і Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction · Veure més »

Distància de Levenshtein

La distància de Levenshtein també anomenada distància d'edició o distància entre paraules és en teoria de la informació i la informàtica, el nombre mínim d'edicions requerides per a transformar una cadena de caràcters en una altra.

Nou!!: Alineament de seqüències і Distància de Levenshtein · Veure més »

Earth BioGenome Project

L'Earth BioGenome Project (EBP) és una iniciativa que té com a objectiu seqüenciar, catalogar i caracteritzar el genoma de tota la biodiversitat eucariota de la Terra.

Nou!!: Alineament de seqüències і Earth BioGenome Project · Veure més »

EMBOSS

EMBOSS (acrònim procedent de l'anglès European Molecular Biology Open Programari Suite) és una eina bioinformàtica de codi obert creada per EMBnet (Xarxa Europea de Bioinformàtica), i que s'utilitza especialment en els àmbits de la biologia molecular i la genètica.

Nou!!: Alineament de seqüències і EMBOSS · Veure més »

Ensembl

Ensembl és un projecte científic conjunt entre l'Institut Bioinformàtic Europeu i el Wellcome Trust Sanger Institute (ambdós amb seu a Cambridge, Regne Unit), el qual va ser fundat el 1999 com a resposta a la finalització imminent del Projecte del Genoma Humà. Després de 10 anys d'existència, l'objectiu d'Ensembl segueixent sent proporcionar un recurs centralitzat per genetistes, biòlegs moleculars i altres investigadors que estudien els genomes de l'espècie humana i d'altres vertebrats i organismes model.

Nou!!: Alineament de seqüències і Ensembl · Veure més »

Exploració de patrons seqüencials

La mineria de patrons seqüencials és un tema de mineria de dades que s'ocupa de trobar patrons estadísticament rellevants entre exemples de dades on els valors s'entreguen en una seqüència.

Nou!!: Alineament de seqüències і Exploració de patrons seqüencials · Veure més »

FASTA

FASTA és un programa informàtic d'alineament d'àcids desoxiribonucleics (ADN) i proteïnes descrit inicialment com a FASTP per David J. Lipman i William R. Pearson el 1985 en l'article.

Nou!!: Alineament de seqüències і FASTA · Veure més »

Filoviridae

Filoviridae és una família de virus d'ARN monocatenari (-) que pertany a l'ordre del Mononegavirales.

Nou!!: Alineament de seqüències і Filoviridae · Veure més »

Gap penalty

Una Gap penalty, o penalització per buit, com podria dir-se en català, és, en Bioinformàtica, una puntuació típicament negativa assignada a un gap, o buit, en un alineament de dues o més seqüències.

Nou!!: Alineament de seqüències і Gap penalty · Veure més »

GenBank

GenBank és una base de dades pública que conté seqüències de nucleòtids i anotacions bibliogràfiques i biològiques de suport.

Nou!!: Alineament de seqüències і GenBank · Veure més »

HMMER

HMMER és un paquet de programari lliure utilitzat per a l'anàlisi de seqüències creat per Sean Eddy.

Nou!!: Alineament de seqüències і HMMER · Veure més »

K-mer

El terme k-mer fa referència a totes les subcadenes possibles de longitud k contingudes en una cadena.

Nou!!: Alineament de seqüències і K-mer · Veure més »

Matriu de punts

teler jacquard. Vista de primer pla del text de matriu de punts produïda per una impressora d'impacte. "Bling Bling": Dot matrix-style skywriting. Una matriu de punts és un patró en una matriu de 2-dimensions, que s'utilitza per representar caràcters, símbols i imatges.

Nou!!: Alineament de seqüències і Matriu de punts · Veure més »

Matriu de substitució

En termes de bioinformàtica i biologia evolutiva, una matriu de substitució descriu la velocitat a la qual un caràcter en una seqüència de nucleòtids o en una seqüència de proteïnes és canviat per altres caràcters al llarg del temps evolutiu.

Nou!!: Alineament de seqüències і Matriu de substitució · Veure més »

Peak calling

El peak calling (en català: identificació de pics o, literalment, crida de pics) és un mètode computacional que permet identificar els llocs d'unió de proteïnes putatives.

Nou!!: Alineament de seqüències і Peak calling · Veure més »

Predicció de gens

ADN. En general, la predicció de gens tracta de localitzar en les llargues seqüències d'ADN, i de forma automatitzada, les subsecuencias de nucleòtids que conformen els diferents gens. Els mecanismes o processos de predicció de gens (general Prediction en anglès, o també general finding, literalment descobriment de gens) són aquells que, dins l'àrea de la biologia computacional, s'utilitzen per a la identificació algorísmica de trossos de seqüència, usualment ADN genòmic, i que són biològicament funcionals.

Nou!!: Alineament de seqüències і Predicció de gens · Veure més »

Predicció de l'estructura de les proteïnes

La predicció de l'estructura de les proteïnes és la predicció o càlcul de l'estructura tridimensional d'una proteïna a partir de la seva seqüència d'aminoàcids, és a dir, la predicció de les seves estructures secundària i terciària a partir de la seva estructura primària.

Nou!!: Alineament de seqüències і Predicció de l'estructura de les proteïnes · Veure més »

Seqüència conservada

En el context de l'evolució, una seqüència conservada és aquella seqüència homòloga d'àcids nucleics (ADN i ARN) o de proteïna idèntica o semblant entre espècies (ortòloga), entre el mateix genoma (paràloga) o generada per transferència horitzontal de gens entre diferents espècies que comparteixen un ancestre comú (xenòloga).

Nou!!: Alineament de seqüències і Seqüència conservada · Veure més »

T-Coffee

T-Coffee (Tree-based Consistency Objective Function For alignment Evaluation) és una aplicació bioinformàtica utilitzada per a l'alineament múltiple de seqüències que utilitza un algorisme progressiu avaluat mitjançant la consistència emprant una llibreria d'alineaments.

Nou!!: Alineament de seqüències і T-Coffee · Veure més »

UniProt

UniProt (Universal Protein Resource) és una base de dades de seqüències de proteïnes i la seva corresponent informació funcional.

Nou!!: Alineament de seqüències і UniProt · Veure més »

Redirigeix aquí:

Alineació de seqüències.

SortintEntrant
Hey! Estem a Facebook ara! »