Logo
Uniopèdia
Comunicació
Disponible a Google Play
Nou! Descarregar Uniopèdia al dispositiu Android™!
Gratis
Accés més ràpid que el navegador!
 

K-mer

Índex K-mer

El terme k-mer fa referència a totes les subcadenes possibles de longitud k contingudes en una cadena.

22 les relacions: Alineament de seqüències, Assemblatge de seqüències, Còntig, DNA barcoding, Entropia de Shannon, Eucariotes, Genoma humà, Haplogrup, Illumina (empresa), Metagenòmica, Microbiota, Mitocondri, Mutació, Polimorfisme (biologia), Procariotes, Proteïna, Recombinació genètica, RNA-Seq, Seqüenciació d'ADN, Transferència horitzontal de gens, Transposó, Vèrtex (teoria de grafs).

Alineament de seqüències

Un alineament de seqüències en bioinformàtica és una forma de representar i comparar dues o més seqüències o cadenes d'ADN, ARN, o estructures primàries proteiques per ressaltar les seves zones de similitud, que podrien indicar relacions funcionals o evolutives entre els gens o proteïnes consultades.

Nou!!: K-mer і Alineament de seqüències · Veure més »

Assemblatge de seqüències

En bioinformàtica, l'assemblatge de seqüències es refereix a alinear i fusionar fragments curts d'una seqüència d'ADN per tal de reconstruir la seqüència original més llarga.

Nou!!: K-mer і Assemblatge de seqüències · Veure més »

Còntig

Un còntig és un fragment llarg d'ADN producte de l'assemblatge de seqüències més curtes mitjançant eines bioinformàtiques.

Nou!!: K-mer і Còntig · Veure més »

DNA barcoding

DNA barcoding o codi de barres d'ADN és un mètode d'identificació d'espècies basat en la utilització d'un curt fragment d'ADN d'un gen o gens específics.

Nou!!: K-mer і DNA barcoding · Veure més »

Entropia de Shannon

Dos bits d'entropia: en el cas de llançar a l'aire dues monedes justes, l'entropia d'informació en bits és el logaritme en base 2 del nombre de possibles resultats; amb dues monedes hi ha quatre possibles resultats, i dos bits d'entropia. En general, l'entropia d'informació és la quantitat mitjana d'informació que es transmet en un esdeveniment, considerant-ne tots els possibles resultats. Lentropia de Shannon, (formulada per Claude Shannon) (archived from) (archived from) és una funció matemàtica que intuïtivament es correspon amb la quantitat d'informació continguda o lliurada per una font d'informació.

Nou!!: K-mer і Entropia de Shannon · Veure més »

Eucariotes

Arbre filogenètic. Els eucariotes apareixen en marró, a la dreta. Els noms científics en llatí apareixen en cursiva. Els eucariotes (de noms científics Eucaryotae, Eukaryotae, Eukarya o Eucarya) són, en taxonomia i histologia, el domini d'organismes cel·lulars amb nucli diferenciat, i altres orgànuls tancats dins de les membranes biològiques, contraposats així als procariotes.

Nou!!: K-mer і Eucariotes · Veure més »

Genoma humà

El genoma humà és el genoma dHomo sapiens, és a dir, les seqüències que contenen els 23 parells de cromosomes en el nucli de cada cèl·lula humana diploide.

Nou!!: K-mer і Genoma humà · Veure més »

Haplogrup

Un haplogrup en l'estudi de l'evolució molecular és un grup gran d'haplotips, que són sèries d'al·lels en llocs específics d'un cromosoma.

Nou!!: K-mer і Haplogrup · Veure més »

Illumina (empresa)

Illumina Inc. és una empresa nord-americana la seu de la qual s'allotja a San Diego, Califòrnia.

Nou!!: K-mer і Illumina (empresa) · Veure més »

Metagenòmica

La metagenòmica és la ciència que estudia els gens microbians extrets directament de comunitats en mostres ambientals sense cultivar.

Nou!!: K-mer і Metagenòmica · Veure més »

Microbiota

La mucosa de l'estómac hostatja certs microorganismes.Una d'aquestes espècies (''Helicobacter pylori'') té un paper en l'úlcera gastroduodenal Una microbiota és la totalitat de microorganismes, els seus elements genètics (genomes), i la interacció mediambiental dins un ambient biofísic particular.

Nou!!: K-mer і Microbiota · Veure més »

Mitocondri

Micrografia electrònica de dos mitocondris del teixit pulmonar d'un mamífer en els quals es poden apreciar la matriu i les membranes. Un mitocondri és un orgànul envoltat per una doble membrana que es troba en la majoria de les cèl·lules eucariotes.

Nou!!: K-mer і Mitocondri · Veure més »

Mutació

En biologia, una mutació és una alteració de la seqüència de nucleòtids del genoma d'un organisme, virus o ADN extracromosòmic.

Nou!!: K-mer і Mutació · Veure més »

Polimorfisme (biologia)

El polimorfisme és la presència de més d'una variant al·lèlica per a un determinat gen, bé sigui en una població o espècie.

Nou!!: K-mer і Polimorfisme (biologia) · Veure més »

Procariotes

Arbre filogenètic. Els procariotes són els dos arbres de l'esquerra. Els noms científics en llatí apareixen en cursiva. Els procariotes (del grec pros.

Nou!!: K-mer і Procariotes · Veure més »

Proteïna

Representació tridimensional de la mioglobina, que mostra acolorides les hèlix alfa. L'estructura d'aquesta proteïna va ser la primera que Max Perutz i Sir John Cowdery Kendrew van resoldre per cristal·lografia de raigs X l'any 1958, fet pel qual van rebre el Premi Nobel de Química de l'any 1962. Les proteïnes, també denominades polipèptids, són compostos orgànics fets d'aminoàcids arranjats en una cadena lineal i units per enllaços peptídics entre els grups carboxil i amino de residus adjacents.

Nou!!: K-mer і Proteïna · Veure més »

Recombinació genètica

La recombinació genètica és el procés pel qual una cadena de material genètic (habitualment ADN, però també pot ser ARN) és fragmentat i posteriorment unit a una molècula d'ADN diferent.

Nou!!: K-mer і Recombinació genètica · Veure més »

RNA-Seq

RNA-seq (seqüenciació d'RNA), també anomenat Seqüenciació del Transcriptoma Sencer per Clonatge a l'atzar (de l'anglés Whole Transcriptome Shotgun Sequencing), utilitza la seqüenciació massiva (NGS) per revelar la presència i quantitat d'RNA en una mostra biològica a un moment donat.

Nou!!: K-mer і RNA-Seq · Veure més »

Seqüenciació d'ADN

La seqüenciació d'ADN és cadascun dels mètodes de laboratori que tenen per objectiu determinar l'ordre dels nucleòtids adenina, guanina, citosina, i timina en un fragment d'ADN.

Nou!!: K-mer і Seqüenciació d'ADN · Veure més »

Transferència horitzontal de gens

La transferència horitzontal de gens, o HGT (de les sigles en anglès de horizontal gene transfer), també trasllat de gens lateral (LGT), és qualsevol procés en el qual un organisme transfereix material genètic a una altra cèl·lula que no és el seu descendent.

Nou!!: K-mer і Transferència horitzontal de gens · Veure més »

Transposó

Esquema d'un transposó d'ADN Els transposons són seqüències d'ADN que es poden desplaçar al llarg de diferents posicions del genoma d'una cèl·lula, procés que és anomenat transposició.

Nou!!: K-mer і Transposó · Veure més »

Vèrtex (teoria de grafs)

Un graf amb sis vèrtexs i set arestes on el vèrtex número 6 a l'extrem esquerre és un vèrtex fulla En matemàtiques, i més especialment en teoria de grafs, un vèrtex (plural vèrtexs) o node és la unitat fonamental de la qual es formen els grafs: un graf no dirigit consisteix en un conjunt de vèrtexs i un conjunt d'arestes (parells no ordenats de vèrtexs), mentre que un graf dirigit consisteix en un conjunt de vèrtexs i un conjunt d'arcs (parells ordenats de vèrtexs).

Nou!!: K-mer і Vèrtex (teoria de grafs) · Veure més »

SortintEntrant
Hey! Estem a Facebook ara! »