Taula de continguts
28 les relacions: Algorisme, Algorisme de Needleman-Wunsch, Algorisme de Smith-Waterman, Alineament de seqüències, Aminoàcid, Avantpassat comú, Àcid desoxiribonucleic, Àcid ribonucleic, Biologia computacional, BLAST, Cinasa, Deleció, Distribució normal, Divergència genètica, Domini proteic, Evolució, FASTA, Funció exponencial, Homologia (biologia), Logaritme, Margaret Oakley Dayhoff, Mutació, Nucleòtid, Programació dinàmica, Proteïna, Seqüenciació total del genoma, Significació estadística, Triptòfan.
Algorisme
nombres primers Un algorisme (o, alternativament, algoritme) és un conjunt finit d'instruccions o passos que serveixen per a executar una tasca o resoldre un problema.
Veure Gap penalty і Algorisme
Algorisme de Needleman-Wunsch
L'algorisme de Needleman–Wunsch és un algorisme àmpliament utilitzat en bioinformàtica per a l'alineament global de seqüències proteiques o nucleotídiques.
Veure Gap penalty і Algorisme de Needleman-Wunsch
Algorisme de Smith-Waterman
L'algorisme de Smith-Waterman és un dels algorismes més emprats per a l'alineament local de seqüències proteiques o nucleotídiques, i en permet determinar les regions de major similitud.
Veure Gap penalty і Algorisme de Smith-Waterman
Alineament de seqüències
Un alineament de seqüències en bioinformàtica és una forma de representar i comparar dues o més seqüències o cadenes d'ADN, ARN, o estructures primàries proteiques per ressaltar les seves zones de similitud, que podrien indicar relacions funcionals o evolutives entre els gens o proteïnes consultades.
Veure Gap penalty і Alineament de seqüències
Aminoàcid
Els aminoàcids són compostos orgànics que contenen els grups funcionals amino (-NH₂) i carboxil (-COOH), així com una cadena lateral diferent en cada aminoàcid.
Veure Gap penalty і Aminoàcid
Avantpassat comú
Avantpassat comú és el terme usat per descriure a l'ésser viu o espècie del qual descendeixen dues o més espècies, o de l'ésser viu del qual descendeixen dos o més éssers vius dins d'una espècie.
Veure Gap penalty і Avantpassat comú
Àcid desoxiribonucleic
Làcid desoxiribonucleic (ADN, conegut igualment per la sigla anglesa DNA) és una molècula composta de dues cadenes de polinucleòtids enrotllades al llarg d'un eix comú que formen una doble hèlix amb les instruccions genètiques per al desenvolupament, el funcionament, el creixement i la reproducció de tots els organismes coneguts i molts virus.
Veure Gap penalty і Àcid desoxiribonucleic
Àcid ribonucleic
Comparació de l'ARN amb l'ADN (en anglès) L'àcid ribonucleic (ARN, conegut igualment per la sigla anglesa RNA) és una molècula polimèrica que té un paper fonamental en la codificació, la descodificació, la regulació i l'empalmament dels gens.
Veure Gap penalty і Àcid ribonucleic
Biologia computacional
La biologia computacional és una disciplina que es basa en l'ús d'eines informàtiques aplicades al camp de la biologia.
Veure Gap penalty і Biologia computacional
BLAST
El BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) és un programa informàtic d'alineament de seqüències de tipus local ja sigui d'ADN o de proteïnes.
Veure Gap penalty і BLAST
Cinasa
Estructura del grup fosfat Esquema de la fosforilació Les cinases són un gran grup d'enzims del tipus transferasa, o sigui, biocatalitzadors la funció dels quals és accelerar i, per tant, facilitar reaccions en què es transfereixen grups funcionals d'una molècula a una altra que tenen lloc a la cèl·lula, als òrgans i a tot l'organisme en general.
Veure Gap penalty і Cinasa
Deleció
Deleció d'un cromosoma. Una deleció genètica és una alteració genètica en la que una part d'una seqüència d'àcids nucleics, ja sigui en un cromosoma, plasmidi o ARN missatger entre d'altres, s'ha perdut.
Veure Gap penalty і Deleció
Distribució normal
La distribució normal, també coneguda com a distribució gaussiana, és una important família de distribucions de probabilitat contínues i és aplicable a molts camps.
Veure Gap penalty і Distribució normal
Divergència genètica
La divergència genètica és el procés en el qual dos o més poblacions d'una espècie ancestral acumulen canvis genètics independents (mutacions) a través de temps, sovint després que les poblacions s'hagin convertit en poblacions reproductives aïllades per algun període.
Veure Gap penalty і Divergència genètica
Domini proteic
Proteïna amb set dominis diferents. Cada color correspon a un domini diferent. Un domini proteic és una agrupació globular de cadenes polipeptídiques que forma una regió molt conservada d'una proteïna, i que té una estructura terciària que pot existir, funcionar i evolucionar independentment de la resta de la cadena peptídica.
Veure Gap penalty і Domini proteic
Evolució
L'evolució és el procés segons el qual els caràcters hereditaris d'una població d'organismes canvien amb el pas de les generacions.
Veure Gap penalty і Evolució
FASTA
FASTA és un programa informàtic d'alineament d'àcids desoxiribonucleics (ADN) i proteïnes descrit inicialment com a FASTP per David J. Lipman i William R. Pearson el 1985 en l'article.
Veure Gap penalty і FASTA
Funció exponencial
En sentit ampli, una funció exponencial és qualsevol funció del tipus ax, una potenciació on la base a és qualsevol nombre real positiu i l'exponent x és la variable.
Veure Gap penalty і Funció exponencial
Homologia (biologia)
Carl Gegenbaur: Homologia entre membres anteriors (1870) En l'estudi comparatiu dels éssers vius, l'homologia és la relació que existeix entre dues parts orgàniques diferents quan els seus determinants genètics tenen el mateix origen evolutiu.
Veure Gap penalty і Homologia (biologia)
Logaritme
mai l'interseca. Gràfiques de les funcions logarítmiques per a diverses bases ''b'': vermell en base ''e'', verd en base 10, i morat en base 1,7. La gràfica talla l'eix de les abscisses a ''x''.
Veure Gap penalty і Logaritme
Margaret Oakley Dayhoff
Margaret Belle (Oakley) Dayhoff (Filadèlfia, Estats Units, 11 de març de 1925-Silver Spring, Maryland, ibidem, 5 de febrer de 1983) va ser una fisicoquímica pionera en el camp de la bioinformàtica.
Veure Gap penalty і Margaret Oakley Dayhoff
Mutació
En biologia, una mutació és una alteració de la seqüència de nucleòtids del genoma d'un organisme, virus o ADN extracromosòmic.
Veure Gap penalty і Mutació
Nucleòtid
Els nucleòtids són les unitats estructurals bàsiques dels àcids nucleics, és a dir que els àcids nucleics estan formats per l'encadenament de nucleòtids.
Veure Gap penalty і Nucleòtid
Programació dinàmica
Dins de l'entorn de la informàtica, la programació dinàmica és un mètode per a reduir el temps d'execució d'un algorisme mitjançant la utilització de subproblemes superposats i subestructures òptimes, com es descriu a continuació.
Veure Gap penalty і Programació dinàmica
Proteïna
Representació tridimensional de la mioglobina, que mostra acolorides les hèlix alfa. L'estructura d'aquesta proteïna va ser la primera que Max Perutz i Sir John Cowdery Kendrew van resoldre per cristal·lografia de raigs X l'any 1958, fet pel qual van rebre el Premi Nobel de Química de l'any 1962.
Veure Gap penalty і Proteïna
Seqüenciació total del genoma
llengua.
Veure Gap penalty і Seqüenciació total del genoma
Significació estadística
La significació estadística és la verificació matemàtica que el resultat de la mesura d'un paràmetre d'una mostra supera o no un determinat llindar o valor prèviament i arbitràriament establert per tal de discernir que aquest paràmetre és degut a l'atzar o bé a un efecte causal.
Veure Gap penalty і Significació estadística
Triptòfan
El triptòfan (abreviat Trp o W) és un aminoàcid essencial en la nutrició humana.
Veure Gap penalty і Triptòfan